Открытие Хоготовской церковно – приходской школы состоялось в 1861 году. Для неё была специально построена изба – в одной половине был класс, в другой – квартира для учителя. Училось тогда 12-13 человек, это были дети зажиточных людей Хогота и близлежащих улусов и деревень, включая Верхоленский уезд.
В 1890 году было построено новое более удобное помещение, и школа была преобразована в двухклассное училище, почётным блюстителем и законоучителем которого был священник Василий Тархов. Вторым учителем была Пляскина Валентина Иннокентьевна. О Пляскиной тепло вспоминает Омбоев, учащийся 1900 – 1904 годов. Он писал, что она не только учила детей наукам, но и занималась подготовкой их к жизни. Учила детей огородничеству, совместно сажали деревья на территории школы и села.
В 1912 году школа стала школой четырёхгодичным обучением. После революции 1917 года школа была преобразована в высшее начальное училище, директором которой стал Рукис Ян Анцевич (в школе его звали Иван Андреевич), латыш по национальности. До этого он пробыл на каторге и тюрьме 5 лет 7 месяцев и прибыл в Хогот в ссылку. Рукис И.А. 26 лет проработал в Хоготовской школе, был её директором. Имел почётное звание Заслуженный учитель школы РСФСР.
В 1920 году Хоготовской высшее начальное училище реорганизуется в школу второй ступени с 9-летним сроком обучения. В том же году из – за отсутствия здания школу переводят в улус Хорой – 3 (Харагун), где местные жители – богачи предоставили дома для школы и квартиры учителям. Это было сделано по настоянию Харахинова Михаила Кузьмича – уроженца этого улуса, работавшего в то время врачом в г. Москва. В 1920 году в школе училось 56 учеников: 48 мальчиков и 8 девочек. Через два года число учеников выросла до 87 (66 мальчиков, 21 девочка).
В 1923 году школа 2-й ступени была принята на аймачный бюджет, и учителя впервые в декабре 1923 года получили оплату труда не мукой и мясом, а деньгами.
В 1923 году в школе организована комсомольская ячейка, в неё вошло 10 комсомольцев. В 1925 году школа 2-й ступени выпустила первых учеников. В том же году было принято решение вернуть школу в Хогот. Для этого было построено новое здание. Кроме того, школе передали хошунное (волостное) здание и здание тюрьмы. Школа 2 –й ступени просуществовала до 1928 года. В 1928 году в Усть – Орде открылась средняя школа, и старшие классы были переведены в эту школу, а в Хоготе остались 1-7 классы. Школа второй ступени произвела 2 выпуска. Первый в 1926 г. – 6 человек, второй в 1928 г. – 12 человек.
Оканчивающим её присваивалось звание учителя начальных классов. Учащиеся вели большую работу на селе, помогали ликвидировать неграмотность среди взрослого населения, ставили концерты, агитировали родных вступать в колхозы и первыми вступали в них сами. В грозные годы гражданской войны из школьников была создана дружина самообороны, вооружённая боевыми винтовками и пистолетами.
С 1928 года школе присвоили статус школы крестьянской молодёжи. Было введено преподавание сельскохозяйственных дисциплин, организована учебно – производственная база. Школа имела 20 га пахотной земли, до 100 га сенокосных угодий, 4 коровы, 4 лошади, свиней, набор сельскохозяйственных машин. При школе имелся огород, где под руководством учителя – агронома Копылова Александра Осиповича выращивали богатый урожай овощей. При школе имелся интернат, в котором проживало до 75 учеников. Продуктами учащиеся обеспечивали себя сами. 1 мая 1928 года в школе впервые заговорило радио. В 1934 году ШКМ стала неполной средней школой.